Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms