Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stfa3P35173 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms