Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif5cP28738 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif5cP28738 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms