Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NapbP28663 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NapbP28663 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NapbP28663 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NapbP28663 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NapbP28663 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NapbP28663 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NapbP28663 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NapbP28663 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NapbP28663 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NapbP28663 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NapbP28663 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NapbP28663 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NapbP28663 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NapbP28663 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NapbP28663 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NapbP28663 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NapbP28663 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NapbP28663 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NapbP28663 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NapbP28663 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NapbP28663 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NapbP28663 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NapbP28663 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NapbP28663 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NapbP28663 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NapbP28663 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NapbP28663 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NapbP28663 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NapbP28663 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NapbP28663 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NapbP28663 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NapbP28663 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NapbP28663 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms