Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Celf1P28659 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf1P28659 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Celf1P28659 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf1P28659 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf1P28659 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf1P28659 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf1P28659 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf1P28659 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf1P28659 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms