Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Hoxd10P28359 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Hoxd10P28359 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Hoxd10P28359 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Hoxd10P28359 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Hoxd10P28359 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Hoxd10P28359 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Hoxd10P28359 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd10P28359 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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