Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms