Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd40lgP27548 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd40lgP27548 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd40lgP27548 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms