Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af2P26369 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af2P26369 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af2P26369 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af2P26369 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U2af2P26369 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms