Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cdk11bP24788 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk11bP24788 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms