Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gria1P23818 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gria1P23818 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms