Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxd11P23813 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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