Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja1P23242 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja1P23242 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja1P23242 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja1P23242 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms