Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PparaP23204 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PparaP23204 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PparaP23204 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PparaP23204 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PparaP23204 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PparaP23204 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PparaP23204 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PparaP23204 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PparaP23204 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PparaP23204 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PparaP23204 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PparaP23204 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PparaP23204 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PparaP23204 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PparaP23204 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PparaP23204 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PparaP23204 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PparaP23204 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PparaP23204 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PparaP23204 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PparaP23204 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PparaP23204 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PparaP23204 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PparaP23204 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PparaP23204 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PparaP23204 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PparaP23204 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PparaP23204 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PparaP23204 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PparaP23204 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PparaP23204 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PparaP23204 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PparaP23204 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PparaP23204 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PparaP23204 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PparaP23204 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PparaP23204 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PparaP23204 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PparaP23204 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PparaP23204 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PparaP23204 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PparaP23204 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PparaP23204 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PparaP23204 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PparaP23204 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PparaP23204 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PparaP23204 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PparaP23204 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PparaP23204 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PparaP23204 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PparaP23204 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PparaP23204 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PparaP23204 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PparaP23204 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PparaP23204 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PparaP23204 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PparaP23204 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PparaP23204 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PparaP23204 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PparaP23204 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PparaP23204 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PparaP23204 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PparaP23204 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PparaP23204 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PparaP23204 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PparaP23204 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PparaP23204 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PparaP23204 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PparaP23204 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PparaP23204 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PparaP23204 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms