Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms