Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmnb2P21619 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmnb2P21619 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms