Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc2P20801 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc2P20801 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms