Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn1s1P19228 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms