Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp53P15975 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp53P15975 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp53P15975 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp53P15975 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp53P15975 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp53P15975 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms