Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms