Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms