Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga5P11688 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga5P11688 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga5P11688 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga5P11688 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga5P11688 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms