Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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DmdP11531 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DmdP11531 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DmdP11531 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DmdP11531 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DmdP11531 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DmdP11531 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DmdP11531 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DmdP11531 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DmdP11531 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DmdP11531 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DmdP11531 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DmdP11531 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DmdP11531 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DmdP11531 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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DmdP11531 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DmdP11531 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DmdP11531 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DmdP11531 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DmdP11531 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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DmdP11531 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DmdP11531 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DmdP11531 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DmdP11531 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DmdP11531 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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DmdP11531 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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DmdP11531 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DmdP11531 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DmdP11531 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DmdP11531 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DmdP11531 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DmdP11531 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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DmdP11531 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DmdP11531 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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DmdP11531 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DmdP11531 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DmdP11531 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DmdP11531 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DmdP11531 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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DmdP11531 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DmdP11531 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DmdP11531 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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DmdP11531 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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DmdP11531 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DmdP11531 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DmdP11531 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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DmdP11531 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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DmdP11531 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DmdP11531 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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DmdP11531 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DmdP11531 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DmdP11531 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DmdP11531 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DmdP11531 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DmdP11531 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DmdP11531 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DmdP11531 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DmdP11531 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DmdP11531 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DmdP11531 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DmdP11531 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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