Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa1P11477 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa1P11477 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa1P11477 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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