Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fv4P11370 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fv4P11370 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms