Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P10404 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P10404 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P10404 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P10404 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P10404 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P10404 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P10404 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P10404 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P10404 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P10404 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P10404 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P10404 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P10404 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P10404 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P10404 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P10404 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P10404 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P10404 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P10404 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms