Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms