Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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