Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms