Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms