Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms