Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtaP09225 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LtaP09225 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtaP09225 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtaP09225 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtaP09225 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtaP09225 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtaP09225 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtaP09225 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtaP09225 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtaP09225 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtaP09225 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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