Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc8P09025 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc8P09025 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms