Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LtkP08923 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LtkP08923 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LtkP08923 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LtkP08923 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LtkP08923 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LtkP08923 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LtkP08923 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
LtkP08923 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtkP08923 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtkP08923 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LtkP08923 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LtkP08923 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LtkP08923 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LtkP08923 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LtkP08923 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LtkP08923 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LtkP08923 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LtkP08923 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LtkP08923 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LtkP08923 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtkP08923 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtkP08923 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtkP08923 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtkP08923 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LtkP08923 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtkP08923 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtkP08923 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtkP08923 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtkP08923 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtkP08923 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LtkP08923 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtkP08923 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtkP08923 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtkP08923 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtkP08923 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtkP08923 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtkP08923 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtkP08923 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtkP08923 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtkP08923 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtkP08923 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtkP08923 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtkP08923 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtkP08923 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtkP08923 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtkP08923 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtkP08923 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtkP08923 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtkP08923 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LtkP08923 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtkP08923 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtkP08923 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtkP08923 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms