Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NefmP08553 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NefmP08553 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NefmP08553 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NefmP08553 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NefmP08553 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NefmP08553 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NefmP08553 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NefmP08553 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NefmP08553 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NefmP08553 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NefmP08553 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NefmP08553 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NefmP08553 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NefmP08553 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NefmP08553 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NefmP08553 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NefmP08553 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NefmP08553 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NefmP08553 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NefmP08553 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NefmP08553 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NefmP08553 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NefmP08553 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NefmP08553 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NefmP08553 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NefmP08553 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NefmP08553 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NefmP08553 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NefmP08553 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NefmP08553 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NefmP08553 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NefmP08553 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NefmP08553 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NefmP08553 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NefmP08553 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NefmP08553 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NefmP08553 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NefmP08553 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NefmP08553 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NefmP08553 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NefmP08553 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NefmP08553 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NefmP08553 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NefmP08553 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NefmP08553 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NefmP08553 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NefmP08553 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NefmP08553 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NefmP08553 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NefmP08553 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NefmP08553 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NefmP08553 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NefmP08553 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NefmP08553 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NefmP08553 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NefmP08553 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefmP08553 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NefmP08553 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NefmP08553 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NefmP08553 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NefmP08553 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NefmP08553 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NefmP08553 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NefmP08553 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NefmP08553 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NefmP08553 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NefmP08553 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NefmP08553 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NefmP08553 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NefmP08553 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NefmP08553 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NefmP08553 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NefmP08553 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NefmP08553 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NefmP08553 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NefmP08553 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NefmP08553 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NefmP08553 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NefmP08553 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NefmP08553 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NefmP08553 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefmP08553 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefmP08553 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefmP08553 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefmP08553 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms