Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06344 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06344 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06344 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06344 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06344 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06344 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06344 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06344 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06344 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06344 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06344 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06344 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06344 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06344 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06344 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06344 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P06344 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P06344 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P06344 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06344 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06344 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06344 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06344 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06344 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms