Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06323 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06323 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06323 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06323 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06323 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P06323 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06323 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06323 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06323 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06323 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06323 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06323 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06323 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06323 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P06323 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06323 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P06323 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
P06323 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P06323 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P06323 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P06323 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P06323 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P06323 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P06323 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06323 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P06323 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms