Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06321 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06321 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06321 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06321 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06321 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06321 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06321 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06321 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06321 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06321 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06321 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P06321 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P06321 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P06321 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P06321 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P06321 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P06321 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P06321 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P06321 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P06321 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms