Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JunP05627 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JunP05627 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JunP05627 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JunP05627 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JunP05627 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
JunP05627 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JunP05627 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JunP05627 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JunP05627 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JunP05627 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JunP05627 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JunP05627 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JunP05627 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JunP05627 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JunP05627 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JunP05627 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JunP05627 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JunP05627 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JunP05627 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JunP05627 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JunP05627 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JunP05627 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JunP05627 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JunP05627 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JunP05627 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JunP05627 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JunP05627 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JunP05627 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JunP05627 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
JunP05627 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JunP05627 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JunP05627 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JunP05627 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JunP05627 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JunP05627 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JunP05627 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JunP05627 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JunP05627 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JunP05627 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JunP05627 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JunP05627 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JunP05627 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JunP05627 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JunP05627 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JunP05627 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JunP05627 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JunP05627 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JunP05627 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JunP05627 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
JunP05627 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JunP05627 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
JunP05627 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JunP05627 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JunP05627 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JunP05627 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JunP05627 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JunP05627 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JunP05627 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JunP05627 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JunP05627 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JunP05627 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JunP05627 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JunP05627 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JunP05627 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JunP05627 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
JunP05627 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JunP05627 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JunP05627 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JunP05627 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JunP05627 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms