Protein–RNA interactions for Protein: P04945

Ig kappa chain V-VI region NQ2-6.1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04945 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04945 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04945 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04945 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04945 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04945 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04945 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04945 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04945 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04945 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04945 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04945 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04945 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04945 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04945 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04945 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04945 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04945 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms