Protein–RNA interactions for Protein: P01804

Ig heavy chain V-III region HPC76 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01804 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01804 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01804 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01804 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01804 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01804 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01804 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01804 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01804 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01804 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01804 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01804 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01804 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01804 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01804 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01804 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01804 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01804 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01804 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01804 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01804 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01804 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01804 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01804 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01804 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01804 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01804 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01804 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01804 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01804 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01804 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01804 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01804 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01804 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01804 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01804 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01804 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01804 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01804 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01804 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01804 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01804 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01804 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01804 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01804 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01804 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms