Protein–RNA interactions for Protein: P01799

Ig heavy chain V-III region ABE-47N, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01799 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01799 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01799 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01799 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01799 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01799 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01799 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01799 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01799 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01799 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01799 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01799 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01799 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01799 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01799 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01799 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01799 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01799 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01799 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms