Protein–RNA interactions for Protein: P01796

Ig heavy chain V-III region A4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01796 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01796 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01796 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01796 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01796 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01796 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms