Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PomcP01193 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PomcP01193 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PomcP01193 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PomcP01193 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PomcP01193 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PomcP01193 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PomcP01193 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PomcP01193 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PomcP01193 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PomcP01193 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PomcP01193 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PomcP01193 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PomcP01193 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PomcP01193 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PomcP01193 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PomcP01193 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PomcP01193 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms