Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms