Protein–RNA interactions for Protein: O88783

F5, Coagulation factor V, mousemouse

Predictions only

Length 2,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5O88783 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F5O88783 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
F5O88783 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F5O88783 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F5O88783 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F5O88783 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
F5O88783 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F5O88783 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F5O88783 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F5O88783 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F5O88783 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F5O88783 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F5O88783 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F5O88783 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F5O88783 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F5O88783 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F5O88783 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F5O88783 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F5O88783 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F5O88783 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F5O88783 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F5O88783 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F5O88783 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F5O88783 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F5O88783 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F5O88783 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F5O88783 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F5O88783 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F5O88783 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F5O88783 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F5O88783 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F5O88783 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F5O88783 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F5O88783 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F5O88783 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F5O88783 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F5O88783 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F5O88783 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F5O88783 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F5O88783 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F5O88783 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F5O88783 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F5O88783 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F5O88783 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F5O88783 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F5O88783 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F5O88783 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F5O88783 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.1 ms