Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tom1O88746 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tom1O88746 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tom1O88746 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tom1O88746 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tom1O88746 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1O88746 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1O88746 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1O88746 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tom1O88746 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms