Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BlmO88700 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BlmO88700 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
BlmO88700 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BlmO88700 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BlmO88700 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BlmO88700 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BlmO88700 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BlmO88700 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BlmO88700 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BlmO88700 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BlmO88700 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BlmO88700 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BlmO88700 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BlmO88700 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BlmO88700 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BlmO88700 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BlmO88700 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BlmO88700 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BlmO88700 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BlmO88700 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BlmO88700 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BlmO88700 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BlmO88700 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BlmO88700 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BlmO88700 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BlmO88700 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BlmO88700 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
BlmO88700 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BlmO88700 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BlmO88700 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BlmO88700 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BlmO88700 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BlmO88700 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BlmO88700 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BlmO88700 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BlmO88700 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BlmO88700 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BlmO88700 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BlmO88700 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BlmO88700 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BlmO88700 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BlmO88700 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BlmO88700 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BlmO88700 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BlmO88700 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BlmO88700 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BlmO88700 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BlmO88700 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BlmO88700 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BlmO88700 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BlmO88700 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BlmO88700 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BlmO88700 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BlmO88700 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BlmO88700 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BlmO88700 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BlmO88700 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BlmO88700 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BlmO88700 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BlmO88700 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BlmO88700 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BlmO88700 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BlmO88700 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BlmO88700 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BlmO88700 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BlmO88700 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BlmO88700 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BlmO88700 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BlmO88700 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BlmO88700 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BlmO88700 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BlmO88700 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BlmO88700 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BlmO88700 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BlmO88700 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BlmO88700 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BlmO88700 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BlmO88700 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BlmO88700 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BlmO88700 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BlmO88700 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BlmO88700 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BlmO88700 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BlmO88700 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
BlmO88700 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BlmO88700 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BlmO88700 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BlmO88700 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BlmO88700 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BlmO88700 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms