Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sema3fO88632 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3fO88632 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms