Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AurkcO88445 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AurkcO88445 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkcO88445 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms